어떠한 연동을 말씀을 하시는건지는 정확하게 모르겠으나 저희가 제공을 해드리고 있는 ftp는 폴더로 구분을 해서 pc와 모바일을 관리를 하고 있습니다. 

최상위 ftp에 접속을 해보시면 design 폴더가 있고 design_m이라는 폴더가 있는데요..

design폴더가 pc쪽 관련 정보고 design_m이 모바일관련 폴더입니다. 

동일한 파일을 사용을 하는경우도 있으니 연동처리가 된다고 말씀드리는게 맞을것 같네요..